Предприниматель, использующий труд наемных работников при ведении и УСН-деятельности, и деятельности, переведенной на ЕНВД, платит НДФЛ с доходов работников в разные инспекции.

Источник: Письмо Минфина от 28.10.2019 № 03-04-05/82926

А именно: НДФЛ с выплат сотрудникам, занятым в ЕНВД-деятельности, ИП перечисляет в бюджет по месту своего учета в качестве «вмененщика». А налог с доходов сотрудников, занятых в сфере бизнеса, облагаемой в рамках УСН, уплачивается по месту жительства ИП.

Справки 2-НДФЛ и расчет 6-НДФЛ предприниматель-«совместитель» представляет в аналогичном порядке.

Естественно, чтобы иметь возможность исполнять обязанности налогового агента по НДФЛ надлежащим образом, ИП, совмещающему УСН и ЕНВД, необходимо вести раздельный учет операций по разным видам деятельности.