В случае, когда продавец указал в счете-фактуре неверную ставку НДС, покупатель не сможет принять к вычету налог по такому документу.

Источник: Письмо Минфина от 02.08.2019 № 03-07-11/58375

Ведь основанием для отказа в НДС-вычете является наличие в счете-фактуре таких ошибок, из-за которых налоговики не могут правильно идентифицировать, в частности, ставку НДС и предъявленную покупателю сумму налога.

Следовательно, если, например, продавец забыл о том, что с 01.01.2019 ставка НДС повысилась с 18% до 20% и, оформляя счет-фактуру по товарам (работам, услугам), реализованным после этой даты, указал старую ставку налога, НДС к вычету по такому документу принять не выйдет.