В ходе выездной проверки сотрудники ИФНС имеют право изъять, в том числе документы взаимозависимой с проверяемой фирмой компании.

Источник: Информация ФНС; Определение ВС от 13.06.2019 № 305-ЭС19-7994

Так, проводя выездную проверку, налоговики изъяли документы и носители информации (жесткие диски, USB-накопители), которые принадлежали не самому проверяемому налогоплательщику, а его контрагенту. Посчитав действия проверяющих незаконными, компания обратилась в суд, но судьи подтвердили полномочия налоговиков.

Дело в том, что сотрудники ИФНС имеют право изъять подлинники документов, если у них есть основания полагать, что эти документы могут быть сокрыты или уничтожены. А в данном случае такие подозрения у проверяющих были. Поскольку и сам налогоплательщик, и его контрагент по предположению налоговиков могли являться участниками схемы уклонения от налогов, о чем свидетельствовала обнаруженная проверяющими переписка. Кроме того, была установлена взаимозависимость обеих организаций: они занимали одни и те же офисы, одни и те же  лица управляли денежными потоками и отвечали за бухгалтерский и налоговый учет.